J’ai lu dans une fatwa, l’interprétation du hadith qui dit que les actes ne valent que par leurs intentions. Que dire des actes obligatoires qui sont fait par obligation et non pas forcément par intention ? Comme la prière, le jeûne, le hajj, etc. Par exemple je mets le réveil pour me lever pour le fadjr, je vais prier par obligation et non par intention. Je vais accomplir un devoir par non choix pour éviter une conséquences grave, la désobéissance. Ces actes sont-ils récompensés?

Louange à Allah et que la paix et la bénédiction soient sur Son Prophète et Messager, Mohammed, ainsi que sur sa famille et ses Compagnons :

L'intention qui vous pousse à accomplir des actes d'obéissance est l'Ikhlas (la sincérité) envers Allah le Tout-Puissant. Cela signifie que vous accomplissez cet acte d'adoration en obéissance à l'ordre d’Allah, exalté soit-Il, qui vous l'a imposé. C'est l'essence même de l'adoration d’Allah Tout-Puissant, car l'obéissance à Son commandement implique la magnification du Commandant et la crédibilité de Sa parole.
Abu Bakr ibn al-Arabi a dit dans son ouvrage Al-Qabas Sharh Al-Muwatta' :
« Toutes les actions peuvent être faites pour Allah ou pour autre que Lui. Elles n'ont de valeur que si elles sont faites pour Allah avec l'intention d'obéir à Son commandement et de se rapprocher de Lui. » Fin de citation
Al-Shatibi a mentionné dans Al-Muwafaqat, dans le quatrième chapitre des objectifs de la Sharia, des paroles précieuses auxquelles il est bon de se référer. Il a dit notamment :
« La simple intention d'obéir à l'ordre, à l'interdiction ou à la permission est suffisante pour atteindre tout objectif. » Fin de citation
Il n'est pas une condition de la validité de l'adoration que vous ayez l'intention de rechercher la satisfaction d’Allah ou d'espérer Sa récompense, même si la perfection dans l'adoration consiste à combiner l'intention d'obéissance avec le désir de Sa promesse et la crainte de Sa menace. C'est l'état des prophètes, comme Allah le Tout-Puissant dit :
« Ils s'empressaient de faire le bien, Nous imploraient avec désir et crainte, et étaient humbles devant Nous. » (Coran 21/90)

Vous avez mentionné dans votre question votre crainte des conséquences néfastes de la désobéissance, ce qui confirme que l'être humain, par nature, est enclin à obtenir une part de la récompense et de la rétribution, comme son salut du châtiment. C'est pourquoi Allah Tout-Puissant a encouragé Ses serviteurs à Lui obéir par le Paradis et d'autres récompenses immédiates et futures. Il dit, exalté soit-Il :
« Et quant à celui qui aura craint la position de son Seigneur et interdit à son âme ses passions, alors le Paradis sera son refuge. » (Coran 79/40-41)
Les versets et les hadiths à ce sujet sont très nombreux.
Et Allah sait mieux.